蛋白质结构预测，蛋白质结构预测的一般流程

本文目录一览

1，蛋白质结构预测的一般流程
2，有没有根据序列预测蛋白质结构的软件
3，蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤
4，蛋白质二级结构预测的方法与原理二级结构预测的网站有哪些

1，蛋白质结构预测的一般流程

蛋白质结构预测简单流程：1 提取和纯化目标蛋白。2 蛋白结晶3 X光衍射或核磁共振检测。4 解谱5 重构晶体结构6 验证

蛋白质结构预测的一般流程

2，有没有根据序列预测蛋白质结构的软件

当然有根据序列预测蛋白质结构的软件比如nnPredict，预测全alpha蛋白、全beta蛋白和alpha/beta蛋白的二级结构 PredictProtein，提供了序列搜索和结构预测服务。先搜索相似序列，然后构建多序列比对的轮廓，再在数据库中搜索相似的轮廓，然后用

有没有根据序列预测蛋白质结构的软件

3，蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤

序列分析通常就是指同源性分析、保守位点分析，motif分析和功能预测等，结构预测通常又包括二级结构三级结构甚至四级结构，二级结构目前预测还是比较准确的，三级结构最简单的可以直接将蛋白序列提交swissmodel在线进行预测，也可以采用一些其他软件，如modeller和一些商业软件，主要原理是同源建模，现在也有一些其他方法可以获得结构，但准确性有待提高。

当然有根据序列预测蛋白质结构的软件比如nnpredict，预测全alpha蛋白、全beta蛋白和alpha/beta蛋白的二级结构predictprotein，提供了序列搜索和结构预测服务。先搜索相似序列，然后构建多序列比对的轮廓，再在数据库中搜索相似的轮廓，然后用一套phd程序来预测相应的结构特征，包括二级结构。返回的结果包含大量预测过程中产生的信息，还包含每个残基位点的预测可信度。

蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤

4，蛋白质二级结构预测的方法与原理二级结构预测的网站有哪些

传统的观点认为，蛋白质的一级结构决定它的三维结构，也就决定了其功能。因此，常通过已知的蛋白质序列比对来预测未功能，或者是通过序列来预测蛋白质的一些功能。例如，分析所获序列是否与已知蛋白质序列相似；所获序列是否含有特殊蛋白质家族...

α-螺旋(α-helix) 蛋白质中常见的一种二级结构，肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状，一般都是右手螺旋结构，螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基（第n个）的羰基氧与多肽链c端方向的第4个残基（第n+4个）的酰胺氮形成氢键。在典型的右手α-螺旋结构中，螺距为0.54nm，每一圈含有3.6个氨基酸残基，每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。螺旋的半径为0.23nm。β-折叠(β-sheet) 是蛋白质中的常见的二级结构，是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位于同一个肽链或相邻肽链的另一个酰胺氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链，这些肽链可以是平行排列（走向都是由n到c方向）；或者是反平行排列（肽链反向排列）。β-转角(β-turn) 多肽链中常见的二级结构，连接蛋白质分子中的二级结构（α-螺旋和β-折叠），使肽链走向改变的一种非重复多肽区，一般含有2～16个氨基酸残基。含有5个氨基酸残基以上的转角又常称之环（loops）。常见的转角含有4个氨基酸残基，有两种类型。转角i的特点是：第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键；转角ii的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。